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具有熱魯棒性的適應(yīng)性基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)

劉明; 王宏利 北京大學(xué)物理學(xué)院; 北京100871
  • 適應(yīng)性
  • 功能與拓補(bǔ)
  • 轉(zhuǎn)錄網(wǎng)絡(luò)
  • 溫度補(bǔ)償

摘要:通過對(duì)三節(jié)點(diǎn)基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的枚舉、參數(shù)空間的隨機(jī)采樣以及動(dòng)力學(xué)模擬,找到具有熱魯棒性(即溫度補(bǔ)償)的適應(yīng)性基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò),對(duì)其進(jìn)行結(jié)構(gòu)分析表明,存在3種最基本的結(jié)構(gòu)可以實(shí)現(xiàn)具有熱魯棒性的適應(yīng)性動(dòng)力學(xué)功能,復(fù)雜的適應(yīng)性網(wǎng)絡(luò)都以此3種網(wǎng)絡(luò)為核心骨架。為了考察三節(jié)點(diǎn)適應(yīng)性網(wǎng)絡(luò)的適應(yīng)性對(duì)網(wǎng)絡(luò)動(dòng)力學(xué)中各參數(shù)改變的敏感度,計(jì)算了各參數(shù)相應(yīng)的控制系數(shù)。對(duì)控制系數(shù)的聚類分析表明,三節(jié)點(diǎn)功能網(wǎng)絡(luò)實(shí)現(xiàn)熱魯棒的機(jī)制為溫度隔離,即盡管網(wǎng)絡(luò)中所有的速率參數(shù)都依賴于溫度,但僅輸出節(jié)點(diǎn)的生成和降解速率明顯偏離0且具有相反的符號(hào),大多數(shù)熱魯棒適應(yīng)性都通過輸出節(jié)點(diǎn)的拮抗平衡調(diào)節(jié)來實(shí)現(xiàn)。

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北京大學(xué)學(xué)報(bào)·自然科學(xué)版

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