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大豆NRT1.2同源基因的生物信息學分析

朱林; 左妍妍; 曹金山; 王小迪; 楊薇; 王幼寧 華中農業大學植物科學技術學院; 湖北武漢430070
  • 大豆
  • 氮素營養
  • 共生固氮
  • 生物信息學

摘要:AtNRT1.2已被證明在模式植物擬南芥中作為低親和硝酸根轉運蛋白參與硝態氮的吸收。為研究其編碼基因在大豆中的同源基因,進一步挖掘大豆中參與調控共生固氮的候選基因并為開展其功能研究奠定基礎,本研究利用Phytozome、ProtParam、TAIR和SoyBase數據庫以及GSDS、TMpred Server、ClustalX 2.1和MEGA 7.0軟件,對NRT1.2在大豆中的6個同源蛋白的系統進化關系、基因序列、氨基酸序列、跨膜結構以及表達模式進行生物信息學分析。系統進化分析發現GmNRT1.2a、GmNRT1.2b、GmNRT1.2c和GmNRT1.2d與菜豆和苜蓿等豆科植物的NRT1.2親緣關系較近。氨基酸序列比對分析發現GmNRT1.2a和GmNRT1.2b相似度較高,且GmNRT1.2s都含有類似的跨膜結構。在表達模式方面,SoyBase的數據顯示GmNRT1.2s同源基因的表達存在較明顯差別,GmNRT1.2a和GmNRT1.2b在大豆根及根瘤中表達較高。以上生物信息學分析結果暗示GmNRT1.2s可能在參與硝酸鹽吸收的同時也介導大豆共生固氮過程。本研究結果為深入探究GmNRT1.2s在氮吸收與共生固氮協同調控大豆氮素供給的分子機制方面提供了一定的數據支持。

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大豆科學

  • 預計1-3個月 預計審稿周期
  • 0.79 影響因子
  • 農業 快捷分類
  • 雙月刊 出版周期

主管單位:黑龍江農業科學院;主辦單位:黑龍江農業科學院

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