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適用于轉(zhuǎn)錄組測序的人參根總RNA提取方法的篩選

王穎芳; 陳艷琳; 王文娟 廣東藥科大學(xué)中藥學(xué)院; 廣東廣州510006
  • 長白山人參
  • 總rna
  • 多糖多酚

摘要:目的 篩選適用于轉(zhuǎn)錄組測序的人參根組織總RNA提取方法.方法 以15年生長白山人參為研究對象,比較RNAiso Plus法、Trizol法、改良CTAB法、植物總RNA提取試劑盒、多糖多酚總RNA提取試劑盒(RNA prep Pure Plant Kit)提取人參根組織總RNA,利用瓊脂糖凝膠電泳、Aligent 2100 Bioanalyzer對5種方法提取的總RNA進(jìn)行質(zhì)量檢測.結(jié)果 Trizol法和RNAiso Plus法均能提取到總RNA,1%瓊脂糖凝膠電泳顯示28S、18S條帶清晰穩(wěn)定,D(γ)260 nm/D(γ)280 nm和D(γ)260 nm/D(γ)230 nm值均在2.0左右.Trizol試劑法提取總RNA的28S條帶亮度明顯高于18S,所得RNA濃度達(dá)485.66 ng/μL,經(jīng)Aligent 2100 Bioanalyzer檢測,28S條帶亮度是18S的2倍.RNA prep Pure Plant Kit試劑盒及植物總RNA提取試劑盒提取RNA的條帶模糊、彌散,RNA降解嚴(yán)重.改良CTAB法無法完成人參根組織總RNA的提取.結(jié)論 Trizol試劑法提取的人參根組織總RNA濃度、純度及完整性與其他方法相比效果最佳,能滿足轉(zhuǎn)錄組測序的要求,是人參根組織總RNA提取的首選方法.

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