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一株新型殺鮭氣單胞菌烈性類T4噬菌體Asfd-1的分離鑒定和生物學(xué)特性分析

周燕; 袁盛建; 嚴庭瑋; 馬迎飛 中國科學(xué)院深圳先進技術(shù)研究院合成生物學(xué)研究所(籌)定量合成生物學(xué)研究中心; 深圳518055; 中國科學(xué)院大學(xué); 北京100049; 暨南大學(xué); 廣州510632
  • 殺鮭氣單胞菌
  • 噬菌體治療
  • 生物信息

摘要:噬菌體是自然界中最普遍的生物之一,其專一性裂解細菌的能力在針對耐藥菌感染治療方面具有很大的應(yīng)用前景。殺鮭氣單胞菌(Aeromonas salmonicide)是水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)中一種主要病原菌,其引發(fā)的癤瘡病是一種常見的水產(chǎn)養(yǎng)殖動物疾病,具有高死亡率和高發(fā)病率,一旦爆發(fā),將給水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)帶來重大的經(jīng)濟損失。該研究以殺鮭氣單胞菌MF663675.1為宿主菌,從深圳海鮮市場的污水中,采用雙層瓊脂平板法分離純化得到單個噬菌體,通過電鏡對其表觀形態(tài)特征進行觀察,并運用生物信息的方法進一步確定其基因型特征及遺傳分類地位。研究結(jié)果表明,分離出的烈性噬菌體命名為Asfd-1,噬菌斑呈圓形,輪廓分明、透明,直徑約1mm。電鏡觀察顯示,Asfd-1具有對稱的二十面體頭部,以及長度為51 nm的收縮尾部。基因組測序和基因?qū)Ρ确治霰砻?Asfd-1含雙鏈脫氧核糖核酸(dsDNA),全基因組大小為168 962 bp,鳥嘌呤(G)和胞嘧啶(C)所占的比例為41.53%,共編碼263個開放閱讀框和16個轉(zhuǎn)移核糖核酸(tRNA)序列,Genbank登錄號為MK577502。根據(jù)國際病毒分類委員會規(guī)定的病毒分類方法,與同源的Aeromonas phage 31 GCA000862645.1和Aeromonas phiSA4GCA002710125.1全基因組對比結(jié)果顯示,Asfd-1是新型噬菌體。綜合電鏡觀察結(jié)果及系統(tǒng)進化樹分析,Asfd-1屬于肌尾科下的T4噬菌體屬、肌尾噬菌體科、有尾噬菌體目的新成員。該研究可為應(yīng)用噬菌體治療細菌感染提供進一步的參考。

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