摘要：為了開發南酸棗植物的微衛星分子標記,本研究基于Illumina-HiSeq2000測序平臺對南酸棗葉片和果實的轉錄組進行高通量測序。利用MISA軟件對獲得的轉錄組數據庫進行搜索與分析,共鑒別出15168個SSR位點,SSR位點的發生頻率為25.52%,平均分布距離3.98kb,以單核苷酸重復類型相對比例最高,占總數的62.32%,二核苷酸重復類型和三核苷酸重復類型分別占18.74%和17.47%。利用GenScript在線軟件設計出150對SSR引物,以不同來源南酸棗4個無性系DNA樣品對150對SSR引物進行擴增效率檢驗,發現有115對引物可擴增出清晰條帶,其中25對引物具有多態性。本研究結果表明,利用高通量測序技術開發南酸棗SSR分子標記是一種簡單而高效的途徑,可為南酸棗的居群遺傳多樣性、遺傳結構以及種質資源鑒定研究奠定基礎。