摘要：新疆裸重唇魚和斑重唇魚為新疆維吾爾自治區土著魚類。21世紀初,由于利益驅使和人類活動,資源遭到嚴重破壞,目前兩者分別列為自治區Ⅰ、Ⅱ級水生野生保護動物。自治區漁業部門也針對其資源量開展增殖放流活動,但在物種資源保護研究方面進展緩慢,未見種群遺傳多樣性相關研究報道。本研究采集新疆裸重唇魚和斑重唇魚鰭條樣本,利用16對同亞科魚類微衛星引物對兩個物種進行了種內多態性分析和種質鑒定。遺傳參數分析發現,兩群體平均觀測雜合度(Ho)分別為0.454和0.367,平均期望雜合度(He)分別為0.397和0.245,斑重唇魚的多態信息含量(PIC)范圍在0.180~0.616之間,新疆裸重唇魚的多態信息含量(PIC)范圍在0.124~0.740之間,斑重唇魚種群的遺傳多樣性要高于新疆裸重唇魚,但遺傳多樣性均處于較低水平,需加強保護。