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基于遺傳算法預(yù)測2D三向的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)

夏慧芳; 郭雨珍; 江宏昊 南京航空航天大學(xué)理學(xué)院數(shù)學(xué)系; 南京211106
  • 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測
  • 范德華力勢能
  • 遺傳算法
  • 調(diào)整算子

摘要:本文基于范德華力勢能預(yù)測2D三向的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)。首先,將蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測這一生物問題轉(zhuǎn)化為數(shù)學(xué)問題,并建立基于范德華力勢能函數(shù)的數(shù)學(xué)模型。其次,使用遺傳算法對數(shù)學(xué)模型進(jìn)行求解,為了提高蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測效率,我們在標(biāo)準(zhǔn)遺傳算法的基礎(chǔ)上引入了調(diào)整算子這一概念,改進(jìn)了遺傳算法。最后,進(jìn)行數(shù)值模擬實驗。實驗的結(jié)果表明范德華力勢能函數(shù)模型是可行的,同時,和規(guī)范遺傳算法相比,改進(jìn)后的遺傳算法能夠較大幅度提高算法的搜索效率,并且遺傳算法在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測問題上有巨大潛力。

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