摘要：目的建立香附ISSR分子標記的方法,對10個不同種源香附的遺傳多樣性和親緣關系進行分析。方法采用ISSR分子標記技術和非加權平均距離法(UPGMA)對不同種源香附進行遺傳多樣性和聚類分析。結果從51條ISSR引物中篩選出14條擴增條帶清晰且重復性好的引物,共擴增出116條帶,其中多態性條帶106個,總多態位點百分率(PPB)為91.7%;Nei’s基因多樣性指數(H)為0.309 8,Shannon’s多態性信息指數(I)為0.471 3;種源間遺傳相似度范圍在0.396 6~0.801 6,遺傳距離范圍在0.298 9~0.882 3;根據ISSR聚類分析結果可將10個不同種源的香附分為2大類群。結論ISSR可作為研究香附遺傳多樣性及遺傳分化的有效標記。香附種質資源間具有很高的多態性,遺傳多樣性水平較為豐富;遺傳親緣關系與產地具有一定的相關性,但地理位置不是唯一主導因素。